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中共肺炎(武漢肺炎)全球疫情嚴峻，秋冬防疫專案將自12月起實施，指揮中心25日宣布，除了緊急協處、來自無法自費篩檢國家、部會專案經指揮中心同意的三種情形外，其餘來臺旅客登機前須出示3日內核酸檢驗報告。
指揮中心指揮官陳時中指出，境外檢驗的目的，在於讓航空公司於旅客登機前可瞭解旅客個人健康狀況，並依據旅客防疫風險，於機上採取適當預防措施，降低傳播風險，另若入境後才採檢，亦可能造成大批旅客在機場滯留等待採檢，增加感染機會。
指揮中心進一步表示，若旅客登機前無法出示3日內COVID-19核酸檢驗報告，但符合以下三種情形，不予裁罰。適用對象包括本國人、持居留證之外籍人士及持居留證之陸港澳人士；不適用經臺轉機旅客。
首先為緊急協處，例如奔喪(限二等親以內)、探視重病親屬(限二等親以內)、緊急就醫專案等，請旅客於航空公司報到(check in)時主動切結及檢附佐證文件(死亡證明書、病危通知書、診斷證明書等)，並依航空公司安排機上指定區域搭乘；入境時須自費接受採檢。
其次來自無法自費篩檢國家，包括大洋洲(吐瓦魯國、紐埃、斐濟及東加)等；請旅客於航空公司報到(check in)時主動切結，並依航空公司安排機上指定區域搭乘；入境時須自費接受採檢。
最後部會專案經指揮中心同意，如必要且短期公務商務行程，並於境外採取適當防疫措施，請旅客於航空公司報到(check in)時主動切結及檢附經報准等佐證文件，並依航空公司安排機上指定區域搭乘；入境時依專案核定之防疫檢疫措施辦理。
指揮中心說明，若旅客無法出示3日內核酸檢驗報告，且未符合上述情形即逕自返臺，除仍須依航空公司安排機上指定區域搭乘，入境時須自費接受採檢外，後續不得申請防疫補償，並將依據《傳染病防治法》第58條及第69條，處新臺幣1萬元至15萬元罰鍰。如經確診中共肺炎(武漢肺炎)而有傳染於他人之虞者，亦須負相關刑責。
