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「重啟核四」、「反萊豬進口」、「公投綁大選」、「珍愛藻礁」等四大公投案投票在18日展開，據中選會公布的開票結果，4案不同意票均大於同意票，遭全面否決。
據「公民投票法」第29條，公投的有效同意票數多於不同意票，且有效同意票達投票權人總額四分之一以上者，才算是通過，換算下來，代表通過門檻必須達到495萬6367票。
而據中選會公佈的結果，4案公投案都沒有過門檻。第17案「重啟核四」同意票：380萬4755張、不同意票：426萬2451張；第18案「反萊豬進口」同意票：393萬6554張、不同意票：413萬1203張；第19案「公投綁大選」同意票：395萬1882張、不同意票：412萬零38張；第20案「三接遷離」同意票：390萬1171張、不同意票：416萬3464張。
特別的是，台北市的4個公投案都是同意票數大於不同意票數，與最終結果相反。據台北市選委會統計，4案同意票皆大過不同意票。投票率皆超過47%，為全國最高，且同意票皆大於不同意票。不過，僅憑台北市仍難以扭轉最終投票的結果。
在公投案結果公布後，總統蔡英文發表講話，指出公投沒有誰輸誰贏的問題，只有國家未來要怎麼走的問題。這次公投的過程，傳達出4個明確的訊息。
4個訊息，包括：臺灣人民希望走向世界，願意積極參與國際；臺灣人民支持能源轉型、期待穩定供電，並維持經濟成長的動能；臺灣人民重視生態環保，希望經濟和環保能夠達成雙贏；臺灣人民期待公共政策能夠資訊透明、被理性地討論。
這次公投之前，副總統賴清德共參與106場說明會，成為全民進黨最多，賴清德也在臉書上發文，感謝國人支持執政團隊的路線。他說，這次公投，台灣的環境安全、能源轉型、國際接軌與民主價值，國人已經做出選擇。
行政院長蘇貞昌晚間出席行政院記者會時針對公投結果表示，眾用直接民權表達對政策的堅定支持，讓他更有信心、也知道要更努力完成民眾託付，讓台灣走出去、能源轉型走下去。
他說，公投本應就事論事，有政黨操作成為倒閣公投、或是對政府的不信任投票，都偏離公投意旨，非常感謝民眾透過公投表達集體智慧。
行政院政務委員、經貿談判辦公室總談判代表鄧振中則說，公投結果將讓各國收到非常清楚的訊息，台灣有決心遵守國際規範，對參與CPTPP和推動台美關係，相信將有新局面。
朱立倫：把戰友找回來 不要再找戰犯
國民黨主席朱立倫在中央黨部召開記者會除了表達歉意，他說，身為黨主席，他必須要承擔責任，而國民黨作為在野黨努力還不夠，要更加努力，同時呼籲，把戰友找回來，不要再去找戰犯。
朱立倫指出，這次公投結果，對臺灣的民主是大傷害，因為公投已死，今後大概很難再有任何公投案，在鳥籠式公投制度下可以通過。對於臺灣的新民主獨裁政府是個勝利，但是對於追求深化民主的公民團體、民眾，這次是民主非常大的傷害。而公投跟大選分開，就是把公投關回鳥籠裡面，這次公投結果也印證了，公投應該要綁大選的重要性。
朱立倫表示，面對龐大的行政資源、國家資源，作為在野黨必須跟民眾站、跟所有在野力量站在一起，團結所有在野的力量，才有辦法對抗民主獨裁的政府。他強調，國民黨的力量還不夠，一定要更加努力，也不會氣餒，會再接再厲。
朱立倫也提到，這次公投挑戰選前所有民調，因為民調顯示民眾真正的意願，但因為沒辦法跟大選結合在一起，非常多選民因為工作、學業等原因，所以投票率也創最低，似乎出來投的回到藍綠基本盤。他必須要承認，國民黨、尤其是他個人努力不夠，沒有辦法召喚選民出來投票。
對於黨內許多人都把矛頭指向新北市長侯友宜，朱立倫重申，他做為黨主席，他負最大責任，必須承擔，並再次重申，大家要趕快把戰友找回來，不要找戰犯。
侯友宜：尊重結果、願意承擔
新北市長侯友宜透過聲明指出，四大公投案舉行投開票，各投開票所秩序良好，感謝辛苦的投開票所人員及警察同仁維持秩序。他重申，公投是人民意志的表達，「尊重公投的結果，呼籲大家團結，一起向前走！」對於這次的公投結果，他願意承擔。
柯文哲：議題複雜 投票動力低
台灣民眾黨主席、台北市長柯文哲說，4大公投門檻都未過關，顯示各政黨各說各話、毫無交集，讓多數選民對這次公投感到厭棄；而4大公投牽涉到食品安全、能源政策、環境永續，選舉制度變革等複雜議題，很少人有充足的時間與資訊量做出全面性的判斷，投票動力更低。
盧秀燕：尊重民眾表達意見
台中市長盧秀燕在選前未直接針對公投案表態，盧秀燕在選後指出，公投是人民的權利，社會上對於公共事務或政策，有不同的想法，民眾已透過公投表達意見。公投結果已產生，她與及市府均表尊重。
台灣基進：民主深化的體現
針對四大公投結果，台灣基進18日在臉書指出，四個公投提案被否決，而且是不同意票高過同意票的實質否決，意味著公民的民主實踐，伴隨著台灣大局的視野。公投的結果是民主深化的體現，會繼續努力延續民主的榮耀。
台灣基進指出，台灣是在苦難與挑戰中顛簸打造的共同體。不只有殖民的遺緒，民主轉型也是進兩步退一步。本來應該是捍衛共同體生存的公民投票，也被操弄為可能造成內政與外交災難的工具。
台灣基進表示，四個亂政的公投提案被否決，意味著公民的民主實踐。否定「核四重啟」、「三接遷離藻礁」，意味著不允許延宕綠能轉型。否定「禁止萊豬進口」，意味著不允許台美關係倒退。否定「公投綁大選」，意味著不允許公投一再淪為中國操弄台灣大選的工具。
台灣基進提到，台灣基進與民進黨是唯二定調「四個不同意」的政黨。因為四個公投案，全都會造成災難性的後果；推動任何一項同意案的政黨，都只有政黨利益算計而缺乏共同體關懷。
台灣基進批，力推四個公投案的國民黨，再次被證明了是台灣的亂政之源。這次的結果，就是人民用選票重重賞了一個大耳光。公投的結果是民主深化的體現，會繼續努力，在台中第二選區的補選，以及立委林昶佐的罷免案，延續民主的榮耀。
反萊豬公投「不通過」 作家：藍營損失很大
反萊豬被認為是最可能通過的公投案，最終結果仍是「未通過」。中研院社會所社會意向調查，針對選前3週針對公投4大議題的分析資料顯示，發現「反萊豬」一案明顯於最後一週大幅翻轉，其中民進黨支持者不同意的比例，從3週前的60%增加到最後一週的70%，國民黨支持者不同意的比例也從7%增加到15%。
對此，中研院社會所所長陳志柔回應媒體時指出，萊豬議題在最後一週有大幅度的翻轉，有幾大關鍵因素，包括中央提醒民眾該項公投若通過，將帶來的風險成本，特別是美國是台灣抵抗中共威脅的重要盟友，而反萊豬公投的通過，可能降低美國協防台灣的意願，讓中逛武力占台機率增加，因而讓選民有理性思考的機會。
作家蔡詩萍說，「反萊豬公投，國民黨賠了夫人又折兵。」他說，未來萊豬闖關成功，代表日本核食闖關成功也不成問題，但美國與日本不會感謝國民黨，且民進黨與美日等友好關係，勢必更形緊密。
蔡詩萍說，國民黨如果不修補美日關係，在國人心目中的形象會更差，民進黨這次公投丟出「抗中保台」，被國民黨認為荒謬，但民進黨的戰略隱含「國民黨就是傾斜中國（共）」也不願「傾斜美日」的冷箭。
他說，尤其在公投期間，中共官方還直接呼應馬英九前總統對台灣「不自由的民主」的批判。這更足以讓台灣民眾，把國民黨的反萊豬，直接跟反美、反日劃上等號。
反萊豬公投未過 經濟部：努力推動CPTPP
經濟部針對公投的結果發表聲明，指出特別是反萊豬公投遭否決，代表民眾對台灣願意遵守國際規範、持續走向國際及更進一步參與國際經貿連結有高度期待。
經濟部說，無論是推動參與跨太平洋夥伴全面進步協定（CPTPP）或是與主要經貿夥伴的進一步連結，都會持續努力往前推動。
另外，核四與三接等與能源政策有關的公投，牽涉台灣未來的產業發展，經濟部認為，主流意見都認為核四重啟困難重重，並不是適合的選項。至於下一步，經濟部表示，會督導台電朝價值極大化方向，也要跟地方溝通，進行後續規劃。
經部部表示，三接再外推方案獲民眾肯定，可以顧供電、降空污、護藻礁，一定會要求中油讓三接工程如期進行、供氣發電，更要做好生態保護，讓國家發展跟環保價值雙贏。
農委會也針對反萊豬公投未通過的結果進行回應，他們說，感謝國人支持相關政策推行，並顯示國人願意遵守國際規範、積極參與國際市場，將持續推動養豬產業升級作為回應。
