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政府陸續開放美國肉品、日本福島5縣市食品進口，各界關注校園食安。教育部表示，根據《學校衛生法》，食材必須使用中央農業主管機關認證的在地優良產品，教育部在學校午餐契約範本也明訂食材採購要配合國產可溯源食材政策，優先採用具「三章一Q」標示食材。教育部指出，三章一Q食材覆蓋率已達到九成以上。
為提升校園飲食品質，教育部與農委會共同推動學童午餐優先選用在地生產的可追溯性食材政策，並鼓勵學校午餐選用「三章一Q」政策，讓學校採用「有機」、「產銷履歷」、「臺灣優良農產CAS」標章或「臺灣農產品生產追溯QR Code」的優良食材。
根據農委會校園食材使用標章（示）統計，使用國產「三章一Q」食材登錄覆蓋率，2019年為55.93%，2020年為60.71%，2021年為90.17%，逐年上升。
因應政府2021年初開放含萊克多巴胺的美國豬肉進口，家長擔心校園營養午餐會用到含萊劑肉品。教育部2019年8月行文要求各級學校及幼兒園，供應膳食應採用國產豬、牛肉，並於同年11月修正高級中等以下學校契約範本，規範肉品一律採用國產在地優良產品，因此，三章一Q食材覆蓋率逐年上升。
上述規定使學校食材成本增加，因此，政府自2021年起，將國中、小學生每人每餐補助經費自3.5元提高至6元，每年補助費用增加8億元（由12億元增加至20億元），並配合行政院「推動偏鄉學校中央廚房計畫」，自2021年4月1日起提高偏遠地區學校學生補助經費，由每人每餐6元提高至10元，每年補助費用增加8千萬元。◇
