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慈濟大學增設藥學系引發藥界反彈，擔憂可能會出現流浪藥師潮。中華民國藥師公會全聯會表示，對此事已表達嚴正抗議，經過協調，教育部承諾往後增設藥學系所等議題，將事先徵詢該會意見。衛福部則承諾明年發布藥師人力調查報告，且各方同意設立藥學生員額協商平臺。
目前臺灣共9家藥學相關院校，每年招生1,142名學生，這次慈濟大學又將增設藥學系，將增加30名員額，對此，藥師公會全聯會表達「嚴正抗議」，該會屬藥界最具代表性團體之一，但教育部與衛福部卻於未徵詢該會意見就決定，顯非合理。
藥師公會全聯會理事長黃金舜接受媒體聯訪時表示，現在先進國家每一萬人口中，有8.6名藥師服務，但臺灣比例卻已高達每1萬人口有13名藥師，國內藥師已「供過於求」，政府不能漠視。
藥師公會全聯會表示，第一時間就表達了藥學教育制度與藥師執業品質、人力市場，以及國民用藥健康有重大關係，不應貿然增額，相關主管機關應盤點目前藥師人力市場情況，並深入了解各藥學系員額、課程、師資等情況，訂定制度推動藥學教育全面改革。
民進黨立委吳思瑤已於9月21日邀集該會與教育部高教司與技職司、衛福部醫事司與食藥署，共同召開協調會議，教育部及衛福部同意建立各校藥學生員額協商平臺，並於明年初啟動相關會議，邀集藥界相關團體及大學參與。
至於有關「9月28日陳情活動-維護藥學人才素質落實藥學生員額總量管制」，藥師公會全聯會表示，非由該會發起，該會亦不涉及該活動的規劃、宣傳或經費支助等一切事宜，且該活動發起人「維護藥事服務品質，反藥學生增額聯盟」亦與該會無任何關係。◇
