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一名19歲的女大學生，因潰瘍性結腸炎控制不佳，反覆感染困難梭菌（Clostridium difficile），雖然抗生素治療有效，但兩年內復發3次，導致腸道發炎、潰瘍加重，每天拉肚子超過5次，嚴重影響學業。
後續經大腸鏡微菌治療後3個月，不僅困難梭菌感染痊癒，腸道發炎也顯著改善，每日排便次數恢復正常，內視鏡檢查結果顯示腸道黏膜完全癒合，重拾青春生活。
林口長庚醫院副院長邱政洵表示，一般人的腸道有100兆個細菌共生，種類高達數千種，近年醫學研究發現，腸道微菌與人體器官密切運作，像是腦部等，微菌就跟細胞一樣，扮演促進健康的角色。
人體內的微菌叢就像是「隱形器官」，林口長庚微菌治療中心及發炎性腸道疾病中心主任李柏賢表示，因西化飲食、食品添加劑及環境等因素，發炎性腸病在臺灣的盛行率上升6倍，其中包含「克隆氏症」及「潰瘍性結腸炎」。
病患由於腸道黏膜長時間發炎破損，困難梭菌感染在克隆氏症及潰瘍性結腸炎的發生率，超過正常人的2.4倍及8.3倍。復發性困難梭菌感染，會引起偽膜性結腸炎（Pseudomembranous colitis，PMC），臨床症狀包括，腹脹、腹痛、軟便、腹瀉、脫水、便血、發燒，甚至休克。
衛福部自2018年9月6日施行特管辦法後，開放使用微菌治療，就是將健康的腸道菌移植至病患腸道，「以菌易菌」改變腸道菌相，治療成功率近九成，三個月內復發率明顯低於抗生素治療。
針對此類疾病，國外已將腸道微菌叢植入治療（FMT）列為標準首選治療。國外研究顯示，目前接受微菌治療的發炎性腸道疾病患者中，超過六成的臨床症狀都得到改善，並有助於控制腸道黏膜的炎症。
另外，微菌治療在提升癌症免疫治療效果、巴金森氏症、腸躁症、失眠、移植後排斥等，現代醫學難治性疾病上的潛力，也得到許多研究的支持。
李柏賢表示，微菌治療在現代醫學占有重要地位，並為未來的醫療發展帶來了希望的曙光，但他仍呼籲，民眾日常應均衡飲食，多補充水分，攝取膳食纖維，也要避免非必要性長期使用抗生素，才能讓腸內養好菌。◇
